С первых дней войны поселок Лыткарино оказался прифронтовой зоной. Вражеские самолеты стали все чаще и чаще появляться над жилыми домами и цехами ЗЗО. На предприятии было организовано непрерывное дежурство для борьбы с фугасными бомбами, осуществлена светомаскировка производственных корпусов. И хотя ни один фугас не упал на территорию завода, «зажигалок» сотрудники обезвреживали до 300 штук за один налет.
В ноябре 1941 года положение на фронтах стало критическим. Войска вермахта оказались на подступах к Москве. В Лыткарино и его окрестностях были размещены огневые точки противовоздушной обороны, возводились оборонные сооружения. Правительство страны приняло срочное решение об эвакуации еще недостроенного завода в глубокий тыл. Часть оборудования была демонтирована и направлена вместе с группой специалистов на восток в разные места: механосборочное производство системы «Прожзвук» в город Петропавловск Казахской ССР, а производство зеркальных отражателей – в города Сухой Лог и Ирбит Свердловской области.
Сразу же после разгрома немецких войск под Москвой в январе 1942 года было принято решение о срочном восстановлении на ЗЗО производства зеркальных отражателей, организации выпуска бронестекол для самолетов Ил-2, Як-1 и Ла-6, а также призм для смотровых приборов бронетанковой техники. Уже к концу года предприятие выпустило 104 прожекторных зеркала, 729 комплектов бронестекол для боевых самолетов, тысячи призм для смотровых приборов.
Темпы выпуска продукции в последующие годы только наращивались, люди работали по 12–14 часов в сутки. Одновременно продолжалось увеличение энергомощностей и улучшение бытовых условий заводчан. На центральное теплоснабжение было переведено 9 домов, налажена устойчивая работа прачечной, двух дезкамер, бани с пропускной способностью 70 человек в час, детсада и ясель, трех котельных для отопления домов поселка. На балансе ЗЗО в то время находились 23 дома и 15 бараков.